EOS R1 มีระบบป้องกันภาพสั่นไหวแบบ 5 แกนในตัว นั่นหมายถึงว่าเมื่อเลนส์ทั้งหมด1 ทำงานร่วมกับระบบป้องกันภาพสั่นไหวแบบออปติคัลของเลนส์ จะทำให้การบันทึกวิดีโอในสภาวะแสงน้อยมีความเสถียรยิ่งขึ้น สามารถถ่ายภาพในสภาวะแสงน้อยได้ภาพคมชัดยิ่งขึ้น เมื่อทำงานร่วมกับระบบป้องกันภาพสั่นไหวแบบออปติคัลในเลนส์ สามารถป้องกันภาพสั่นไหวสูงสุดถึง 8.52 สต็อป ทำให้การถือกล้องถ่ายภาพในสภาพแสงน้อย การใช้เลนส์ซูเปอร์เทเลโฟโต้ และการเปิดรับแสงในการภาพเป็นเวลานานทำได้อย่างง่ายดาย
1 เลนส์แคนนอนที่รองรับ
2 สูงสุด 8.5 สต็อปที่ศูนย์กลาง และสูงสุด 7.5 สต็อปที่ขอบภาพ